Bộ môn hiện đã và đang có mối quan hệ và hợp tác với:
1. AUF
2. Trung tâm tư vấn và quy hoạch phát triển thuỷ sản - Bộ Nông nghiệp Phát triển Nông thôn.
3. VASEP.
4. NAFIQAD.
5. Viện nghiên cứu Nuôi trồng Thuỷ sản 2, 3.
6. Sở Nông nghiệp Phát triển Nông thôn - Khánh Hòa.
7. Trường Đại học Tasmania, Úc.
8. Trường Đại học Thủy sản Jarkata, Indonesia.
9. Trường Đại học Bourgogne, Pháp.