Bộ môn Toán được thành lập năm 1966 kể từ ngày thành lập Trường Đại học Thủy sản (tiền thân của Trường Đại học Nha Trang), hiện nay là một trong bốn bộ môn trực Khoa Công nghệ thông tin - Đại học Nha Trang.
Nhiệm vụ chính của Bộ môn là quản lý và giảng dạy các học phần Toán bao gồm: Giải tích, Đại số tuyến tính, Lý thuyết xác suất và Thống kê toán, Toán kinh tế,... Mục tiêu là nhằm rèn luyện cho người học khả năng tư duy logic, đồng thời trang bị cho người học các công cụ toán học nhằm mô hình hóa và phân tích định lượng các hiện tượng và quá trình diễn ra trong các hoạt động liên quan đến các chuyên ngành.
Song song với nhiệm vụ đào tạo, Bộ môn đẩy mạnh công tác nghiên cứu khoa học với các lĩnh vực chủ yếu: Toán ứng dụng và Toán lý thuyết như: Lý thuyết xác suất và Thống kê toán, Phương trình vi phân, Toán kinh tế, Tối ưu toán, Bài toán cân bằng,...