VIỆN CNSH&MT TỔ CHỨC KHÓA TẬP HUẤN VỀ GIẢI TRÌNH TỰ

THẾ HỆ MỚI

Đưa tin: Đặng Thúy Bình

Cơ quan Phát triển Quốc tế Hoa Kỳ (USAID) và Quỹ khoa học tự nhiên (NSF), tài trợ chương trình Đối tác Tăng cường Nghiên cứu Khoa học (PEER).  Các dự án được chọn theo tiêu chí cống hiến khoa học, có tác động phát triển trong một quốc gia và tạo ra triển vọng hợp tác mạnh mẽ giữa các nhà khoa học ở các nước đang phát triển với các nhà khoa học Mỹ.

Trường Đại học Nha Trang hiện đang thực hiện 2 dự án PEER “Di truyền học bảo tồn phục vụ cải thiện đa dạng sinh học và tăng cường quản lý tài nguyên tại Đồng bằng sông Mê Kông đang thay đổi”; và “Xây dựng  mạng lưới nghiên cứu đa dạng sinh học di truyền sông Mekong”.

Các dự án nghiên cứu cấu trúc và sự kết nối quần thể của các loài cá với vòng đời khác nhau, và đại diện cho các khu hệ sinh thái (thượng nguồn và lưu vực sông, vùng của sông và vùng ven biển) tại lưu vực sông Mekong, từ đó cho phép đánh giá về ảnh hưởng của việc thay đổi điều kiện môi trường tại khu vực sông Mekong do thay đổi điều kiện thuỷ văn từ việc hình thành các dự án xây đập ở thượng nguồn, do biến đổi khi hậu và do sự phát triển nông nghiệp và công nghiệp. Dự án có sự tham gia của các đối tác đến từ Việt Nam (Trường Đại học Nha Trang, Trường Đại học Cần Thơ), Cam Pu Chia (Viện nghiên cứu và Phát triển Nội đồng) và Lào (Trung tâm Nghiên cứu Nguồn lợi thủy sản).  Những thông tin này có thể được sử dụng như nguồn dữ liệu đầu vào trong việc quản lý môi trường và nguồn lợi, cụ thể như thiết lập các vùng quản lý và xây dựng các chiến lược về bảo tồn đa dạng sinh học.

Hiện nay, các kỹ thuật di truyền hiện đại, đặc biệt là ứng dụng của công nghệ giải trình tự thế hệ mới được ứng dụng rộng rãi trong nghiên cứu hệ gen góp phần giải quyết rất nhiều các vấn đề trong nông nghiệp, y học, môi trường, cũng như trong nghiên cứu đa dạng sinh học và quản lý nguồn lợi tự nhiên. Trong tiến trình thực hiện dự án, Trường Đại học Nha Trang sẽ tổ chức lớp tập huấn về Giải trình tự thế hệ mới với sự hỗ trợ về chuyên môn và kỹ năng thí nghiệm của các chuyên gia từ Đại học Old Dominion và Đại học Texas A&M Corpus Christi, Hoa kỳ. TS.  Jonathan B. Puritz, Jr. và thạc sĩ Sharon J. Furiness sẽ tham gia giảng dạy và hỗ trợ thí nghiệm cũng như xử lý số liệu tin sinh học.

Khóa tập huấn 8 ngày sẽ giới thiệu thực hành phân tích dữ liệu trình tự ngắn (đoạn đọc)  từ Illumina, các hệ thống giải trình tự thé hệ mới, và kỹ thuật RAD sequence. Ngày đầu tiên giới thiệu khái niệm cơ bản của NGS, tư duy tính toán và phân tích dữ liệu trên nền tảng UNIX. 2 ngày sau học viện sẽ được thực hành kỹ thuật Ezrad trong phòng thí nghiệm phân tử. 5 ngày cuối cùng tập trung vào kết nối trình tự, và phân tích các dữ liệu trình tự, phát hiện chỉ thị SNPs, và khảo sát cấu trúc quần thể.

Tham dự khóa tập huấn là các thành viên của dự án " Xây dựng mạng lưới nghiên cứu đa dạng sinh học di truyền sông Mekong " tại Đại học Nha Trang (NTU), Đại học Cần Thơ (CTU), Viện nghiên cứu và Phát triển Nội đồng, Cam Pu Chia và Trung tâm Nghiên cứu Nguồn lợi thủy sản, Lào, cùng các học viên, sinh viên Đại học Nha Trang và Viện Nghien cứu NTTS 3 .